Le territoire du Syctom s’organise en bassins versants, en fonction de trois modes de traitement : tri de la collecte sélective, tri des objets encombrants, incinération des ordures ménagères résiduelles. Dans une logique de proximité géographique pour limiter les transports, chaque bassin versant est associé à un centre de traitement, dans lequel les bennes de collecte des collectivités viennent déverser leurs déchets.